Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RIGQ13278 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
RIGQ13278 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
RIGQ13278 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIGQ13278 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIGQ13278 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RIGQ13278 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RIGQ13278 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
RIGQ13278 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIGQ13278 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIGQ13278 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIGQ13278 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RIGQ13278 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIGQ13278 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIGQ13278 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIGQ13278 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIGQ13278 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RIGQ13278 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIGQ13278 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIGQ13278 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIGQ13278 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIGQ13278 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
RIGQ13278 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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