Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SEC23AQ15436 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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SEC23AQ15436 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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SEC23AQ15436 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SEC23AQ15436 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
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SEC23AQ15436 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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SEC23AQ15436 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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SEC23AQ15436 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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SEC23AQ15436 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
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SEC23AQ15436 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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SEC23AQ15436 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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SEC23AQ15436 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23AQ15436 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SEC23AQ15436 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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