Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
DDX39BQ13838 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
DDX39BQ13838 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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