Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
MKRN4PQ13434 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MKRN4PQ13434 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN4PQ13434 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MKRN4PQ13434 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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