Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CBX3Q13185 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CBX3Q13185 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CBX3Q13185 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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