Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.75□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SCN11AQ9UI33 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
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