Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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FOXQ1Q9C009 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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FOXQ1Q9C009 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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FOXQ1Q9C009 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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FOXQ1Q9C009 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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FOXQ1Q9C009 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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FOXQ1Q9C009 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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