Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNN3Q15417 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CNN3Q15417 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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