Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RIGQ13278 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RIGQ13278 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RIGQ13278 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
RIGQ13278 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIGQ13278 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIGQ13278 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIGQ13278 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RIGQ13278 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RIGQ13278 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RIGQ13278 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIGQ13278 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIGQ13278 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
RIGQ13278 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIGQ13278 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIGQ13278 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIGQ13278 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIGQ13278 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIGQ13278 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RIGQ13278 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIGQ13278 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RIGQ13278 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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