Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 320.5 ms