Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SMC1AQ14683 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SMC1AQ14683 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.2 ms