Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
KLF9Q13886 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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