Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
MRPL49Q13405 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MRPL49Q13405 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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