Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NFX1Q12986 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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