Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CNN3Q15417 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNN3Q15417 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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