Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
PRPF4BQ13523 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PRPF4BQ13523 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRPF4BQ13523 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1205.5 ms