Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNFAIP1Q13829 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
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TNFAIP1Q13829 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
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TNFAIP1Q13829 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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TNFAIP1Q13829 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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TNFAIP1Q13829 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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TNFAIP1Q13829 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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TNFAIP1Q13829 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TNFAIP1Q13829 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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TNFAIP1Q13829 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TNFAIP1Q13829 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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