Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NFX1Q12986 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
NFX1Q12986 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NFX1Q12986 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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