Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms