Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD21O60216 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD21O60216 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD21O60216 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD21O60216 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD21O60216 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD21O60216 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD21O60216 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD21O60216 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD21O60216 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD21O60216 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD21O60216 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms