Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATG4CQ96DT6 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATG4CQ96DT6 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATG4CQ96DT6 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATG4CQ96DT6 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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ATG4CQ96DT6 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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ATG4CQ96DT6 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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ATG4CQ96DT6 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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ATG4CQ96DT6 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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