Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-2.35□□□□□ -2.79
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SHPRHQ149N8 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
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SHPRHQ149N8 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
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SHPRHQ149N8 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SHPRHQ149N8 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
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