Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
SCN5AQ14524 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCN5AQ14524 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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