Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SQSTM1Q13501 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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