Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SQSTM1Q13501 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SQSTM1Q13501 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SQSTM1Q13501 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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