Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX13Q9Y5W8 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNX13Q9Y5W8 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNX13Q9Y5W8 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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