Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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