Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
NCF4Q15080 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
NCF4Q15080 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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