Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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HOXD1Q9GZZ0 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD1Q9GZZ0 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD1Q9GZZ0 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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