Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SURF1Q15526 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SURF1Q15526 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SURF1Q15526 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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