Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HDAC1Q13547 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
HDAC1Q13547 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HDAC1Q13547 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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