Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATRQ13535 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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