Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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PTPRCP08575 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTPRCP08575 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTPRCP08575 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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PTPRCP08575 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRCP08575 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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PTPRCP08575 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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PTPRCP08575 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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PTPRCP08575 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRCP08575 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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