Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RABGEF1Q9UJ41 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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