Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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USP35Q9P2H5 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
USP35Q9P2H5 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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USP35Q9P2H5 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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USP35Q9P2H5 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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USP35Q9P2H5 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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USP35Q9P2H5 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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USP35Q9P2H5 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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USP35Q9P2H5 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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USP35Q9P2H5 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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USP35Q9P2H5 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
USP35Q9P2H5 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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