Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
USP49Q70CQ1 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP49Q70CQ1 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP49Q70CQ1 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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