Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HDAC1Q13547 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HDAC1Q13547 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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