Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GRIK3Q13003 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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