Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3AQ14563 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3AQ14563 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3AQ14563 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3AQ14563 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3AQ14563 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3AQ14563 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3AQ14563 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3AQ14563 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3AQ14563 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3AQ14563 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3AQ14563 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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