Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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