Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
TRAF3Q13114 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
TRAF3Q13114 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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