Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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