Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF260Q3ZCT1 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF260Q3ZCT1 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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