Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PKHD1P08F94 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PKHD1P08F94 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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