Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
TRIM63Q969Q1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRIM63Q969Q1 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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