Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
DDB1Q16531 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
DDB1Q16531 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDB1Q16531 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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DDB1Q16531 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DDB1Q16531 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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DDB1Q16531 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDB1Q16531 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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