Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ATRQ13535 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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ATRQ13535 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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