Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SGCBQ16585 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCBQ16585 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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