Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SEC23BQ15437 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms