Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SEMA3AQ14563 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEMA3AQ14563 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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